La llegada del virus ISA vino a destapar gran parte de las falencias sanitarias de una industria que, en materia productiva, crecía a pasos agigantados, pero que muchas veces dejaba de lado una serie de medidas que recién hoy se toman en cuenta
Por ejemplo, actualmente el Servicio Nacional de Pesca recomienda una serie de medidas sobre manejo de residuos sólidos y líquidos en las plantas de proceso y matanza de salmones que provengan de aquellas áreas declaradas en cuarentena o infectadas por el virus ISA.
Contiene, entre otros procedimientos, aquellos que deben aplicarse con los residuos sólidos en las plantas, los métodos de desinfección autorizados para su aplicación en el líquido que procede de una planta industrial (efluente), las características que deben tener estos efluentes para la eficacia de la desinfección, así como indicaciones sobre los mecanismos de determinación de parámetros relevantes para evaluar la correcta aplicación de las medidas.